44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5471 on replicon NC_010721
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  244  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5051  minor tail family protein  36.11 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4061  minor tail family protein  36 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  34.48 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6226  minor tail family protein  32 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5754  minor tail family protein  31 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7020  minor tail family protein  32 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3878  minor tail family protein  31 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3531  minor tail family protein  30 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  34.91 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  30.43 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  30.43 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  29.57 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  32.14 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  32.14 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  31.96 
 
 
113 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  32.14 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  32.14 
 
 
109 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3932  minor tail family protein  31.3 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  32.14 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  32.14 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  32.69 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  29.46 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  31.25 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  26.55 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  28.18 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  27.27 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  27.27 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  27.47 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  27.27 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  27.47 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  27.47 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2952  prophage LambdaSo, minor tail protein M, putative  28.85 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  27.35 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  25.66 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  25.66 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  29.7 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  30.43 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1089  phage minor tail protein  26.37 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  30.43 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  27.35 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  26.37 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  28 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  25.25 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>