34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3878 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3878  minor tail family protein  100 
 
 
121 aa  248  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5754  minor tail family protein  96.69 
 
 
121 aa  244  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3531  minor tail family protein  95.04 
 
 
121 aa  241  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7020  minor tail family protein  81.82 
 
 
121 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6226  minor tail family protein  81.82 
 
 
121 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4061  minor tail family protein  81.82 
 
 
121 aa  209  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5051  minor tail family protein  80.17 
 
 
121 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  39.67 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  31 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  32.41 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  33.03 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  39.22 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  32.11 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  34.07 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  34.07 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  34.07 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  32.26 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  29.41 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  26.67 
 
 
109 aa  42  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  26.67 
 
 
109 aa  42  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  29.41 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  29.67 
 
 
109 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  26.67 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  26.67 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  29.11 
 
 
134 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  26.67 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  26.67 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  26.25 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  28.28 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  28.28 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  28.28 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  25.56 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  29.25 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  28.28 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>