44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2236 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  100 
 
 
113 aa  236  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  100 
 
 
113 aa  236  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  100 
 
 
113 aa  236  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  99.12 
 
 
113 aa  234  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1089  phage minor tail protein  95.58 
 
 
113 aa  229  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  66.37 
 
 
113 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  44.55 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  44.55 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  44.55 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  44.55 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  44.55 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  45.95 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  45.45 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  45.45 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  45.45 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  44.55 
 
 
109 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  44.55 
 
 
109 aa  96.7  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  44.55 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  44.55 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  43.64 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  43.64 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  44.95 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  39.45 
 
 
109 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  39.45 
 
 
109 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  29.73 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  33.67 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  34 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  35.37 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  37.63 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  35.37 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  32.47 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  36.56 
 
 
113 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  28.3 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  27.47 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  26.13 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  34.15 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  22.02 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  30.68 
 
 
112 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3531  minor tail family protein  28.28 
 
 
121 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5754  minor tail family protein  28.28 
 
 
121 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6226  minor tail family protein  29.27 
 
 
121 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3878  minor tail family protein  28.28 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7020  minor tail family protein  29.76 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  31.94 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>