39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1089 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1089  phage minor tail protein  100 
 
 		 113 aa  236  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  95.58 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  95.58 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  95.58 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  94.69 
 
 		 113 aa  226  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  66.37 
 
 		 113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  48.65 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  47.75 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  47.75 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  47.75 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  47.75 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  45.45 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  45.45 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  40.37 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  40.37 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  43.12 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  31.53 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  32.65 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  35 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  37.8 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  38.71 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  37.8 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  37.63 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  22.94 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  27.03 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  32.47 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  35.37 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  29.73 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  31.82 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  26.37 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1691  phage HK97 GP17-like protein  33.8 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.294427  normal  0.608544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>