24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2106 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2106  SdrH protein, putative  100 
 
 
419 aa  830    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.012562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2069  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  830    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000643074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1487  sdrH protein  46.73 
 
 
481 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000381693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  38.39 
 
 
3333 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5205  collagen adhesion protein, N-terminus  40 
 
 
617 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  39.44 
 
 
484 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  38.98 
 
 
2035 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  45.79 
 
 
928 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  41.98 
 
 
3486 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.78 
 
 
1088 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
736 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  43.42 
 
 
3393 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  39.64 
 
 
444 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  37.23 
 
 
3210 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  38.06 
 
 
489 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  30.53 
 
 
513 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
875 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  32.23 
 
 
857 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.33 
 
 
1888 aa  43.9  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  29.14 
 
 
1584 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  32.05 
 
 
1279 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  40.91 
 
 
2272 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36.9 
 
 
3190 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  25 
 
 
1652 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>