33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0791 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0791  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.219826  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1340  hypothetical protein  62.74 
 
 
259 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299322  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4773  hypothetical protein  50 
 
 
260 aa  235  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0149963  normal  0.0439036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2168  hypothetical protein  47.67 
 
 
218 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0615786  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3380  hypothetical protein  46.91 
 
 
210 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0516  hypothetical protein  45.73 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3924  hypothetical protein  49.1 
 
 
197 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.0000157363  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1813  hypothetical protein  47.98 
 
 
197 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768116  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4040  hypothetical protein  49.35 
 
 
214 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.10225  normal  0.0382421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4251  hypothetical protein  50.63 
 
 
195 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173324  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3682  hypothetical protein  45.03 
 
 
198 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0758613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6564  hypothetical protein  48.73 
 
 
204 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1688  hypothetical protein  45.57 
 
 
191 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0108944  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0140  hypothetical protein  43.14 
 
 
200 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1717  hypothetical protein  42.86 
 
 
205 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1791  hypothetical protein  42.86 
 
 
249 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.7405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2127  hypothetical protein  42.86 
 
 
205 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1620  hypothetical protein  45.62 
 
 
195 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3530  hypothetical protein  43.64 
 
 
195 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3339  hypothetical protein  41.67 
 
 
195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.162777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1687  hypothetical protein  42.41 
 
 
200 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4843  hypothetical protein  42.33 
 
 
201 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1021  hypothetical protein  44.52 
 
 
197 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2210  hypothetical protein  41.46 
 
 
197 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3485  hypothetical protein  44.12 
 
 
182 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1182  hypothetical protein  43.67 
 
 
201 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3082  hypothetical protein  40.72 
 
 
195 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.211768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2609  hypothetical protein  43.04 
 
 
199 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646996  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0988  hypothetical protein  41.67 
 
 
210 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1540  hypothetical protein  39.52 
 
 
198 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1596  hypothetical protein  39.52 
 
 
198 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00989561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1572  hypothetical protein  38.92 
 
 
198 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859986  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1021  hypothetical protein  38.12 
 
 
197 aa  128  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0952714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>