33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3530 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3530  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3082  hypothetical protein  73.08 
 
 		 195 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.211768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3339  hypothetical protein  72.53 
 
 		 195 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2609  hypothetical protein  79.38 
 
 		 199 aa  270  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1596  hypothetical protein  68.21 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00989561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1540  hypothetical protein  68.21 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1572  hypothetical protein  67.63 
 
 		 198 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859986  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2210  hypothetical protein  63.84 
 
 		 197 aa  239  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3924  hypothetical protein  62.57 
 
 		 197 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.0000157363  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6564  hypothetical protein  66.88 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3682  hypothetical protein  62.57 
 
 		 198 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0758613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4251  hypothetical protein  66.88 
 
 		 195 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173324  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1813  hypothetical protein  64.88 
 
 		 197 aa  227  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3380  hypothetical protein  62.57 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3485  hypothetical protein  65.5 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1021  hypothetical protein  51.78 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0952714  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1021  hypothetical protein  64.38 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1687  hypothetical protein  61.11 
 
 		 200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101223  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0516  hypothetical protein  62.94 
 
 		 214 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1791  hypothetical protein  63.12 
 
 		 249 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.7405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1717  hypothetical protein  63.75 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4040  hypothetical protein  64.94 
 
 		 214 aa  216  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.10225  normal  0.0382421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4843  hypothetical protein  62.5 
 
 		 201 aa  216  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2127  hypothetical protein  63.12 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1620  hypothetical protein  56.22 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2168  hypothetical protein  46.35 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0615786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1688  hypothetical protein  45.76 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0108944  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0988  hypothetical protein  43.1 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4773  hypothetical protein  48.1 
 
 		 260 aa  157  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0149963  normal  0.0439036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0140  hypothetical protein  47.06 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1340  hypothetical protein  43.86 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299322  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0791  hypothetical protein  43.64 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.219826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1182  hypothetical protein  41.5 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>