54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0193 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0193  membrane protein-like protein  100 
 
 
262 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1986  protein of unknown function DUF445  21.14 
 
 
345 aa  68.9  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1421  hypothetical protein  28.16 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1908  hypothetical protein  32.79 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00182785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1856  hypothetical protein  32.79 
 
 
415 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1797  hypothetical protein  31.15 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.747365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1632  hypothetical protein  31.15 
 
 
415 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0643525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3544  hypothetical protein  31.15 
 
 
415 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1654  hypothetical protein  30.33 
 
 
415 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000922298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1834  hypothetical protein  30.33 
 
 
415 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1785  hypothetical protein  30.33 
 
 
400 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.651448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1651  hypothetical protein  31.15 
 
 
415 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1601  hypothetical protein  30.16 
 
 
415 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.661113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2347  protein of unknown function DUF445  28.35 
 
 
422 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02420  predicted membrane protein  24.57 
 
 
427 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1692  hypothetical protein  22.92 
 
 
420 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0297982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4691  protein of unknown function DUF445  26.82 
 
 
430 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0542  protein of unknown function DUF445  25.13 
 
 
449 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0319  hypothetical protein  24.54 
 
 
446 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2381  hypothetical protein  24.89 
 
 
431 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116042  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0836  protein of unknown function DUF445  29.13 
 
 
453 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16810  predicted membrane protein  22.98 
 
 
395 aa  52.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.920314  normal  0.0495417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4524  protein of unknown function DUF445  29.41 
 
 
432 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104757  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0473  hypothetical protein  25.7 
 
 
421 aa  52  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1998  protein of unknown function DUF445  29.9 
 
 
447 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0657  protein of unknown function DUF445  31.86 
 
 
426 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2863  hypothetical protein  30.95 
 
 
433 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0677872  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0038  hypothetical protein  23.77 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4743  hypothetical protein  24.18 
 
 
423 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  0.53724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0772  protein of unknown function DUF445  24.14 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6776  protein of unknown function DUF445  25.19 
 
 
418 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1763  hypothetical protein  26.77 
 
 
417 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5378  protein of unknown function DUF445  24.66 
 
 
429 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0030  hypothetical protein  24.11 
 
 
425 aa  46.2  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29018  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10481  transmembrane protein  33.02 
 
 
456 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4572  protein of unknown function DUF445  35.71 
 
 
427 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3660  protein of unknown function DUF445  30.68 
 
 
435 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0641  hypothetical protein  31.52 
 
 
440 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  24.18 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0654  hypothetical protein  31.52 
 
 
440 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3090  protein of unknown function DUF445  27.74 
 
 
421 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000113555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00474  hypothetical protein  21.36 
 
 
409 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2465  protein of unknown function DUF445  25.64 
 
 
428 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1566  hypothetical protein  22.33 
 
 
400 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0102  hypothetical protein  30.36 
 
 
428 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0634  hypothetical protein  31.52 
 
 
440 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0302528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0606  hypothetical protein  23.31 
 
 
451 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3307  protein of unknown function DUF445  25.93 
 
 
437 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0383951  normal  0.0408752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0899  protein of unknown function DUF445  27.27 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000836481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1171  protein of unknown function DUF445  25.81 
 
 
421 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.23014e-26 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  19.46 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0806  hypothetical protein  29.63 
 
 
447 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1327  protein of unknown function DUF445  24.22 
 
 
428 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0453497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3759  hypothetical protein  19.63 
 
 
420 aa  42  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>