31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0100 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0100  OsmC family protein  100 
 
 
127 aa  259  6e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000158096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1413  OsmC family protein  29.25 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  36.49 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  36.49 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  36.49 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  28.44 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  28.57 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.57 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  28.57 
 
 
412 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  32.43 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  32.43 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  27.84 
 
 
406 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  32.5 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  30.26 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  31.31 
 
 
406 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  32.43 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  30.43 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  25.47 
 
 
153 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  28.95 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  27.5 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  29.67 
 
 
407 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  24.51 
 
 
408 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  27.66 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  29.21 
 
 
154 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  32.43 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  29.55 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  28.41 
 
 
411 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  26.97 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  24.24 
 
 
406 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  25.84 
 
 
418 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  29.58 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>