111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4329 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4329  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3600  hypothetical protein  97.62 
 
 		 85 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0375  hypothetical protein  97.62 
 
 		 84 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3651  hypothetical protein  97.62 
 
 		 84 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0370  hypothetical protein  97.62 
 
 		 84 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4013  hypothetical protein  97.59 
 
 		 84 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3991  hypothetical protein  96.39 
 
 		 84 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4107  hypothetical protein  96.39 
 
 		 84 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3914  protein of unknown function DUF526  96.39 
 
 		 84 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0427  hypothetical protein  91.25 
 
 		 83 aa  146  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0405  hypothetical protein  90 
 
 		 84 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0304  hypothetical protein  85.71 
 
 		 86 aa  142  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0356  hypothetical protein  85.71 
 
 		 84 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4151  hypothetical protein  83.33 
 
 		 86 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0464  hypothetical protein  85.19 
 
 		 88 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3271  hypothetical protein  82.5 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0858  hypothetical protein  60.49 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4287  hypothetical protein  55.42 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00075  hypothetical protein  55 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0301  hypothetical protein  53.01 
 
 		 83 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3340  hypothetical protein  51.22 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.605641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3454  hypothetical protein  51.81 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1017  protein of unknown function DUF526  50 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0541508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3220  hypothetical protein  51.9 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000279177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0780  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000301907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02914  hypothetical protein  51.9 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0658  protein of unknown function DUF526  51.9 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0069  hypothetical protein  55 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0566  hypothetical protein  49.4 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3507  hypothetical protein  51.9 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00191657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0290  hypothetical protein  49.4 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0647  hypothetical protein  49.4 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0655  hypothetical protein  51.9 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.601342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3479  hypothetical protein  51.9 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000424382  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02864  hypothetical protein  51.9 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3455  putative cytoplasmic protein  51.9 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3448  hypothetical protein  51.9 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3380  hypothetical protein  51.9 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3550  hypothetical protein  51.9 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.117116  normal  0.856827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4357  hypothetical protein  50.6 
 
 		 99 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000509229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3385  hypothetical protein  51.9 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3264  protein of unknown function DUF526  48.81 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00236527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3186  protein of unknown function DUF526  48.81 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0950653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001982  putative cytoplasmic protein  50 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00479  ATP synthase subunit ETA  48.75 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0088  hypothetical protein  49.38 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3773  protein of unknown function DUF526  51.22 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2551  hypothetical protein  48.75 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0557462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  46.99 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0088  hypothetical protein  50.63 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0625  hypothetical protein  43.04 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2405  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0641  hypothetical protein  43.04 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2004  hypothetical protein  43.21 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2138  hypothetical protein  42.5 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0520  hypothetical protein  46.91 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0459  hypothetical protein  46.91 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0462985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0201  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0081  hypothetical protein  42.47 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.261842  normal  0.96148 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2124  hypothetical protein  41.56 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0151  protein of unknown function DUF526  35.06 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0051  hypothetical protein  42.31 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461056  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2392  protein of unknown function DUF526  38.67 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5144  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5235  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69820  hypothetical protein  42.68 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.240173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6031  hypothetical protein  42.68 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0215  hypothetical protein  50.88 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.739571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0258  hypothetical protein  43.9 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5296  hypothetical protein  41.46 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0191  hypothetical protein  51.79 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5507  hypothetical protein  42.68 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.754805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3099  hypothetical protein  36.25 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  40 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47800  hypothetical protein  53.7 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0117434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0237  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3655  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0524  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220211  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1959  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0238  hypothetical protein  41.38 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0238  hypothetical protein  52.83 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0217  hypothetical protein  39.76 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0524  protein of unknown function DUF526  46.55 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4191  hypothetical protein  44.83 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.975481 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1665  protein of unknown function DUF526  38.67 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0436  hypothetical protein  46.55 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0650  hypothetical protein  47.27 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594144  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6196  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2253  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0117  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2922  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2867  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2878  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2784  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0406  hypothetical protein  47.27 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0255  hypothetical protein  45.45 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3219  hypothetical protein  47.27 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0194  hypothetical protein  47.27 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.297291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1399  hypothetical protein  47.27 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0486  hypothetical protein  47.27 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>