16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0077 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0077  type IV conjugative transfer system protein TraV  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4179  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.28 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.51948  hitchhiker  0.00159684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2652  hypothetical protein  30.18 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.584434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2319  hypothetical protein  29.45 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0175398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0369  sex pilus assembly protein  31.36 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6800  hypothetical protein  29.33 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4219  hypothetical protein  26.8 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.650672  normal  0.513979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0317  hypothetical protein  24.05 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1536  hypothetical protein  31.75 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418133 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3778  hypothetical protein  27.63 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1082  conjugal transfer protein TraV, putative  41.3 
 
 		 165 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.53395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0254  hypothetical protein  27.03 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4443  Type IV conjugative transfer system protein TraV  25.17 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4536  type IV conjugative transfer system protein TraV  25.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4439  type IV conjugative transfer system protein TraV  25.17 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.802446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4225  hypothetical protein  25.5 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>