52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1898 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1898  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  723    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0180  hypothetical protein  43.34 
 
 
351 aa  299  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0175  hypothetical protein  43.34 
 
 
351 aa  299  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0734  hypothetical protein  34.75 
 
 
352 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0915  hypothetical protein  32.77 
 
 
354 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000469929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0734  hypothetical protein  34.65 
 
 
354 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000306687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0920  hypothetical protein  34.65 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0985e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0878  hypothetical protein  33.61 
 
 
357 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.803593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4457  hypothetical protein  33.33 
 
 
357 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0815576  normal  0.55096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0989  hypothetical protein  31.93 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.091017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0721  hypothetical protein  32.96 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000210105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0785  hypothetical protein  32.96 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000815827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0824  hypothetical protein  32.96 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1240  hypothetical protein  31.28 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00140258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3840  protein of unknown function DUF871  30.97 
 
 
342 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.670705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0171  hypothetical protein  31.58 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1471  protein of unknown function DUF871  32.12 
 
 
356 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0678  hypothetical protein  31.3 
 
 
356 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2811  protein of unknown function DUF871  30.83 
 
 
354 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1197  protein of unknown function DUF871  31.07 
 
 
351 aa  136  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.717538 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0969  protein of unknown function DUF871  30.19 
 
 
338 aa  119  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1542  protein of unknown function DUF871  27.75 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1748  hypothetical protein  27.03 
 
 
346 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000772543  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0756  hypothetical protein  26.43 
 
 
361 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0344  hypothetical protein  26.92 
 
 
361 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.847416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0795  hypothetical protein  26.43 
 
 
361 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B07  putative alpha3-beta1 integrin-binding protein  26.76 
 
 
365 aa  100  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0651  hypothetical protein  27.49 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.629148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0889  hypothetical protein  26.16 
 
 
361 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51659e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0704  outer surface protein  26.16 
 
 
361 aa  95.9  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0951  hypothetical protein  27.49 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0886  hypothetical protein  25.89 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4488  hypothetical protein  26.16 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000696181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0706  hypothetical protein  25.89 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1255  protein of unknown function DUF871  24.3 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0842  hypothetical protein  27.22 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0673  protein of unknown function DUF871  28.65 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0691  outer surface protein  26.16 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2140  protein of unknown function DUF871  26.7 
 
 
361 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00019952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0848  hypothetical protein  25.89 
 
 
361 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4494  hypothetical protein  26.76 
 
 
362 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  hitchhiker  0.00000000000164618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0957  hypothetical protein  25.89 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0700  hypothetical protein  27.17 
 
 
362 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0685  hypothetical protein  26.22 
 
 
362 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0882  hypothetical protein  26.9 
 
 
362 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7172e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0880  hypothetical protein  26.95 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0048124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0698  hypothetical protein  26.9 
 
 
362 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0789  hypothetical protein  26.83 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.098324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0750  hypothetical protein  26.83 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0180  hypothetical protein  25.95 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00971266  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1853  hypothetical protein  28.11 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000256109  hitchhiker  0.0000609259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0684  protein of unknown function DUF871  23.63 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>