54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1255 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1255  protein of unknown function DUF871  100 
 
 
364 aa  759    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0651  hypothetical protein  53.63 
 
 
362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.629148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0880  hypothetical protein  53.91 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0048124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0700  hypothetical protein  53.91 
 
 
362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0951  hypothetical protein  53.91 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0842  hypothetical protein  53.63 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0685  hypothetical protein  53.91 
 
 
362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0882  hypothetical protein  53.91 
 
 
362 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7172e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4494  hypothetical protein  53.63 
 
 
362 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  hitchhiker  0.00000000000164618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0698  hypothetical protein  53.63 
 
 
362 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0789  hypothetical protein  53.63 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.098324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0750  hypothetical protein  53.63 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0704  outer surface protein  50.14 
 
 
361 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0691  outer surface protein  50.14 
 
 
361 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0889  hypothetical protein  50.42 
 
 
361 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51659e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0795  hypothetical protein  50.14 
 
 
361 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0756  hypothetical protein  50.14 
 
 
361 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0957  hypothetical protein  50.42 
 
 
361 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0886  hypothetical protein  50.7 
 
 
361 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2140  protein of unknown function DUF871  49.86 
 
 
361 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00019952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0684  protein of unknown function DUF871  48.33 
 
 
360 aa  363  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0706  hypothetical protein  49.02 
 
 
361 aa  363  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4488  hypothetical protein  49.3 
 
 
361 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000696181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0848  hypothetical protein  49.3 
 
 
361 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0344  hypothetical protein  46.83 
 
 
361 aa  349  5e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.847416  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0180  hypothetical protein  46.34 
 
 
363 aa  342  4e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00971266  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0673  protein of unknown function DUF871  46.83 
 
 
363 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1853  hypothetical protein  43.77 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000256109  hitchhiker  0.0000609259 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B07  putative alpha3-beta1 integrin-binding protein  42.93 
 
 
365 aa  298  7e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0171  hypothetical protein  31.69 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0920  hypothetical protein  31.68 
 
 
354 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0985e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0734  hypothetical protein  30.45 
 
 
352 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0734  hypothetical protein  31.15 
 
 
354 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000306687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0878  hypothetical protein  31.32 
 
 
357 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.803593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0915  hypothetical protein  31.02 
 
 
354 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000469929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0785  hypothetical protein  31.13 
 
 
354 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000815827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0824  hypothetical protein  31.13 
 
 
354 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4457  hypothetical protein  30.19 
 
 
357 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0815576  normal  0.55096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0721  hypothetical protein  31.49 
 
 
354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000210105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0989  hypothetical protein  29.51 
 
 
354 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.091017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3840  protein of unknown function DUF871  28.65 
 
 
342 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.670705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0678  hypothetical protein  30.22 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1471  protein of unknown function DUF871  29.23 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1240  hypothetical protein  29.08 
 
 
353 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00140258  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1197  protein of unknown function DUF871  24.31 
 
 
351 aa  110  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.717538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2811  protein of unknown function DUF871  26.32 
 
 
354 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1898  hypothetical protein  24.3 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2227  protein of unknown function DUF871  32.81 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.552996  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1682  hypothetical protein  28.93 
 
 
356 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0969  protein of unknown function DUF871  25.15 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1542  protein of unknown function DUF871  26.2 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0180  hypothetical protein  24.86 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0175  hypothetical protein  24.86 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1748  hypothetical protein  21.86 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000772543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>