54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1197 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1197  protein of unknown function DUF871  100 
 
 
351 aa  721    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.717538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1471  protein of unknown function DUF871  35.13 
 
 
356 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0969  protein of unknown function DUF871  35.1 
 
 
338 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0878  hypothetical protein  34.83 
 
 
357 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.803593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4457  hypothetical protein  34.55 
 
 
357 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0815576  normal  0.55096 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0920  hypothetical protein  35.11 
 
 
354 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0985e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0734  hypothetical protein  34.83 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000306687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3840  protein of unknown function DUF871  35.31 
 
 
342 aa  189  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.670705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0989  hypothetical protein  35.11 
 
 
354 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.091017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0734  hypothetical protein  34.94 
 
 
352 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324117  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1240  hypothetical protein  33.23 
 
 
353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00140258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0721  hypothetical protein  33.99 
 
 
354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000210105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0785  hypothetical protein  33.99 
 
 
354 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000815827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0824  hypothetical protein  33.99 
 
 
354 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0171  hypothetical protein  32.33 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0915  hypothetical protein  33.99 
 
 
354 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000469929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2811  protein of unknown function DUF871  33.62 
 
 
354 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0678  hypothetical protein  33.61 
 
 
356 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1898  hypothetical protein  31.07 
 
 
350 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1542  protein of unknown function DUF871  29.26 
 
 
329 aa  129  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0180  hypothetical protein  28.21 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0175  hypothetical protein  28.21 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0684  protein of unknown function DUF871  28.37 
 
 
360 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0795  hypothetical protein  27.1 
 
 
361 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0756  hypothetical protein  27.1 
 
 
361 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0889  hypothetical protein  27.1 
 
 
361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51659e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0886  hypothetical protein  26.63 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0957  hypothetical protein  26.36 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0848  hypothetical protein  27.3 
 
 
361 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0704  outer surface protein  26.09 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4488  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000696181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0691  outer surface protein  26.29 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0706  hypothetical protein  26.83 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0673  protein of unknown function DUF871  28.49 
 
 
363 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4494  hypothetical protein  27.79 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  hitchhiker  0.00000000000164618 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B07  putative alpha3-beta1 integrin-binding protein  28.07 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0700  hypothetical protein  27.79 
 
 
362 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0685  hypothetical protein  27.52 
 
 
362 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2140  protein of unknown function DUF871  24.86 
 
 
361 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00019952  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1255  protein of unknown function DUF871  24.31 
 
 
364 aa  110  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0842  hypothetical protein  27.52 
 
 
362 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0882  hypothetical protein  27.52 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7172e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0651  hypothetical protein  26.58 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.629148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0951  hypothetical protein  27.52 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0880  hypothetical protein  27.52 
 
 
362 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0048124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0789  hypothetical protein  27.52 
 
 
362 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.098324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0698  hypothetical protein  27.91 
 
 
362 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0750  hypothetical protein  27.52 
 
 
362 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0180  hypothetical protein  24.33 
 
 
363 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00971266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0344  hypothetical protein  24.46 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.847416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1853  hypothetical protein  22.97 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000256109  hitchhiker  0.0000609259 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2227  protein of unknown function DUF871  28.27 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.552996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1748  hypothetical protein  22.56 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000772543  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1682  hypothetical protein  24.49 
 
 
356 aa  49.7  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>