12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1702 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1702  sceD protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242383  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2132  transglycosylase domain-containing protein  65.24 
 
 		 231 aa  294  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00807725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2170  transglycosylase domain-containing protein  65.24 
 
 		 231 aa  294  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0606274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2138  immunodominant antigen A, putative  38.76 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2591  transglycosylase domain-containing protein  34.14 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2646  transglycosylase domain-containing protein  34.14 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  42.57 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  41.43 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  43.28 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  38.67 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  42.25 
 
 		 325 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  40.91 
 
 		 239 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>