More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1584 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0915  IS256-like transposase  100 
 
 
390 aa  810    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.673092  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1259  IS256-like transposase  100 
 
 
390 aa  810    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1584  IS256-like transposase  100 
 
 
390 aa  810    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1587  IS256-like transposase  100 
 
 
390 aa  810    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2011  IS256-like transposase  100 
 
 
390 aa  810    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0655242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1766  transposase mutator type  46.27 
 
 
411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1522  transposase mutator type  43.22 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  38.73 
 
 
410 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  38.73 
 
 
410 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  38.73 
 
 
410 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  38.73 
 
 
410 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  40.05 
 
 
405 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  40.05 
 
 
405 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  40.05 
 
 
405 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  40.05 
 
 
405 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  40.05 
 
 
405 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  40.05 
 
 
405 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  40.05 
 
 
405 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  38.38 
 
 
410 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  38.38 
 
 
410 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  38.38 
 
 
410 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  37.18 
 
 
411 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  37.18 
 
 
411 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  36.25 
 
 
411 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  36.25 
 
 
411 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  262  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  38.48 
 
 
402 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  41.69 
 
 
406 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  39.11 
 
 
402 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  39.11 
 
 
402 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  39.11 
 
 
402 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  39.11 
 
 
402 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  39.11 
 
 
402 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  37.99 
 
 
403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  36.78 
 
 
409 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0323  transposase, mutator type  40 
 
 
374 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0965  transposase, mutator type  40 
 
 
374 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0913563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1067  transposase, mutator type  40 
 
 
374 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  35.45 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0637  transposase, mutator type  39.17 
 
 
374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.270397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  37.57 
 
 
399 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  37.57 
 
 
399 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  36.02 
 
 
419 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  36.02 
 
 
419 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  36.02 
 
 
419 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  35.45 
 
 
399 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  35.19 
 
 
399 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  35.19 
 
 
399 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  36.68 
 
 
428 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  36.68 
 
 
428 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  36.68 
 
 
428 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  37.6 
 
 
413 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  35.5 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  35.5 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  36.41 
 
 
411 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  37.6 
 
 
413 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  35.5 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  36.68 
 
 
428 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  34.78 
 
 
415 aa  242  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  36.56 
 
 
415 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  36.56 
 
 
415 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  34.78 
 
 
415 aa  242  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  34.78 
 
 
415 aa  242  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  34.78 
 
 
415 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  34.78 
 
 
436 aa  242  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  35.19 
 
 
399 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25910  transposase  34.96 
 
 
416 aa  240  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  35.19 
 
 
399 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01800  transposase  34.77 
 
 
418 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  35.5 
 
 
415 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2762  hypothetical protein  97.44 
 
 
122 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.481413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  34.96 
 
 
416 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25830  transposase  34.96 
 
 
416 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  34.96 
 
 
416 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>