31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0108 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0108    100 
 
 		 4496 bp  8913    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  80.95 
 
 		 4500 bp  420  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  80.95 
 
 		 4500 bp  420  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0186  glutamate synthase, large subunit  89.02 
 
 		 4602 bp  91.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  94.12 
 
 		 4689 bp  77.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  91.23 
 
 		 4446 bp  73.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  92.45 
 
 		 4449 bp  73.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0007  glutamate synthase, large subunit  90 
 
 		 4488 bp  71.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000781352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  89.83 
 
 		 4470 bp  69.9  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  80.1 
 
 		 4491 bp  65.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  80.1 
 
 		 4488 bp  65.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0818  glutamate synthase (NADH) large subunit  80 
 
 		 4521 bp  63.9  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  87.5 
 
 		 4407 bp  63.9  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  91.49 
 
 		 4458 bp  61.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  85.14 
 
 		 4578 bp  60  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  90 
 
 		 4548 bp  60  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0761  putative glutamate synthase, ferredoxin-dependent  82.65 
 
 		 4608 bp  60  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  88.68 
 
 		 4449 bp  58  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  88.68 
 
 		 4449 bp  58  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  88.68 
 
 		 4449 bp  58  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  88.68 
 
 		 1533 bp  58  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  92.5 
 
 		 4428 bp  56  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.07 
 
 		 4575 bp  54  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0781  Glutamate synthase (ferredoxin)  86.44 
 
 		 4602 bp  54  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  96.67 
 
 		 1506 bp  52  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  92.11 
 
 		 4383 bp  52  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  86.79 
 
 		 4524 bp  50.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  85.96 
 
 		 4440 bp  50.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  86.79 
 
 		 4449 bp  50.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  90.24 
 
 		 1509 bp  50.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  91.89 
 
 		 4425 bp  50.1  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>