43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3139 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  100 
 
 		 242 aa  435  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  38.36 
 
 		 503 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  39.73 
 
 		 506 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  37.5 
 
 		 503 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  38.52 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  39.63 
 
 		 495 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  38.77 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  37.4 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  38.31 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  39.74 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  37.4 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  37.18 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  38.22 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  36.99 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  36.89 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  33.94 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  36.32 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  35.27 
 
 		 278 aa  131  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  35.56 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  35.4 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  34.5 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  35.84 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  35.86 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  32.23 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  34.31 
 
 		 601 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  38.96 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  33.02 
 
 		 507 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  36.65 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  36.59 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  31.96 
 
 		 508 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  30.05 
 
 		 497 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  33.47 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  30.62 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  34.09 
 
 		 497 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  35.22 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  36.48 
 
 		 646 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  32.85 
 
 		 545 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  29.03 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  33.04 
 
 		 620 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  34.82 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  27.78 
 
 		 481 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  34.74 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>