43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0165 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  100 
 
 		 261 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  72.09 
 
 		 261 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  75.1 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  69.47 
 
 		 262 aa  362  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  74.49 
 
 		 261 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  73.28 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  67.57 
 
 		 278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  68.75 
 
 		 255 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  60.87 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  52.85 
 
 		 495 aa  249  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  50.6 
 
 		 503 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  54.11 
 
 		 503 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  54.47 
 
 		 506 aa  241  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  49.81 
 
 		 245 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  49.03 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  53.09 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  45.17 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  42.69 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  47.69 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  42.08 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  42.15 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  43.43 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  36.33 
 
 		 497 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  33.86 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  35.42 
 
 		 231 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  33.05 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  32.23 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  31.62 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  30.68 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  34.2 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  30.28 
 
 		 601 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  30.8 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  31.67 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  27.45 
 
 		 620 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  27.84 
 
 		 508 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  27.39 
 
 		 507 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  26.53 
 
 		 497 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  32.92 
 
 		 646 aa  89  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  29.15 
 
 		 545 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  31.09 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  25.97 
 
 		 481 aa  79.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>