43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2761 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  90.69 
 
 		 261 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  81.99 
 
 		 262 aa  434  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  81.23 
 
 		 261 aa  428  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  82.03 
 
 		 255 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  71.54 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  65.93 
 
 		 278 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  70.72 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  58.43 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  52.73 
 
 		 503 aa  250  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  53.12 
 
 		 503 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  50.98 
 
 		 506 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  50.8 
 
 		 495 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  47.62 
 
 		 245 aa  208  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  45.95 
 
 		 244 aa  208  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  44.19 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  43.63 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  44.4 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  43.73 
 
 		 244 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  42.69 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  44.44 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  38.06 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  34.66 
 
 		 497 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  35.02 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  35.4 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  33.61 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  30.42 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  32.3 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  32.14 
 
 		 508 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  34.35 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  32.08 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  30.42 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  30.71 
 
 		 601 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  27.57 
 
 		 497 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  28.51 
 
 		 620 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  27 
 
 		 507 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  33.17 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  28.9 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  35.42 
 
 		 646 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  28.79 
 
 		 545 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  31.3 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  28.96 
 
 		 481 aa  85.9  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>