27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3477 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3477    100 
 
 		 270 bp  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257577 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  97.41 
 
 		 1479 bp  480  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  86.15 
 
 		 324 bp  230  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  88.04 
 
 		 324 bp  216  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  82.45 
 
 		 324 bp  145  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  82.45 
 
 		 324 bp  145  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  94.37 
 
 		 324 bp  109  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3075    88.35 
 
 		 192 bp  109  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  94.12 
 
 		 324 bp  103  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3837    83.02 
 
 		 240 bp  101  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458251  normal  0.0624338 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  89.55 
 
 		 327 bp  77.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  89.55 
 
 		 327 bp  77.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  89.83 
 
 		 324 bp  69.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  89.83 
 
 		 327 bp  69.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  87.69 
 
 		 333 bp  65.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  87.69 
 
 		 333 bp  65.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  85.33 
 
 		 330 bp  61.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  85.33 
 
 		 330 bp  61.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  94.74 
 
 		 330 bp  60  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  86.36 
 
 		 378 bp  60  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  94.74 
 
 		 330 bp  60  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  86.79 
 
 		 327 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 		 327 bp  48.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  93.75 
 
 		 330 bp  48.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  96.43 
 
 		 327 bp  48.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  83.58 
 
 		 324 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1702    100 
 
 		 216 bp  46.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>