26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3075 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3075    100 
 
 		 192 bp  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3477    88.35 
 
 		 270 bp  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  88.78 
 
 		 324 bp  107  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  88.12 
 
 		 1479 bp  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  80.75 
 
 		 330 bp  85.7  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  80.75 
 
 		 330 bp  85.7  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  90.32 
 
 		 330 bp  75.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  86.49 
 
 		 330 bp  67.9  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  86.49 
 
 		 330 bp  67.9  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3837    85 
 
 		 240 bp  63.9  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458251  normal  0.0624338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  87.27 
 
 		 330 bp  54  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  87.27 
 
 		 339 bp  54  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  87.27 
 
 		 339 bp  54  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  87.27 
 
 		 330 bp  54  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  88.24 
 
 		 324 bp  54  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  87.27 
 
 		 330 bp  54  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2050  transposase IS911  100 
 
 		 144 bp  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 327 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2190  transposase IS911  100 
 
 		 144 bp  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  84.38 
 
 		 324 bp  48.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 327 bp  48.1  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 		 324 bp  48.1  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  83.58 
 
 		 324 bp  46.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>