97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2190 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2050  transposase IS911  100 
 
 
47 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2190  transposase IS911  100 
 
 
47 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  88.37 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  64.29 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  64.29 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  64.29 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  64.29 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  64.29 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  64.29 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  66.67 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  66.67 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1861  hypothetical protein  61.9 
 
 
239 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  57.14 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  55.81 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  54.76 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  54.76 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  54.76 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  54.76 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4227  hypothetical protein  65.79 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114352  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  57.14 
 
 
492 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
108 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  54.76 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  52.38 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  52.38 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  54.76 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  54.76 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  55 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  55 
 
 
108 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  55 
 
 
108 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  55 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  55 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  55 
 
 
108 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  55 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  55 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
107 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  55 
 
 
108 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  55 
 
 
108 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  55 
 
 
108 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  55 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
107 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  52.38 
 
 
108 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  52.38 
 
 
108 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  47.37 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  52.5 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  52.5 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  52.5 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  52.5 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  52.5 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  52.5 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0288  transposase subfamily  52.5 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.07567e-42  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  52.27 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  52.27 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  52.27 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  52.27 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  50 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  50 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  50 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2093  transposase  47.5 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1313  hypothetical protein  44.74 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  44.74 
 
 
102 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>