16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3837 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3837    100 
 
 		 240 bp  476  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458251  normal  0.0624338 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  82.7 
 
 		 324 bp  113  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  81.54 
 
 		 324 bp  101  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3477    83.02 
 
 		 270 bp  101  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  85.15 
 
 		 324 bp  81.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  85.15 
 
 		 324 bp  81.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  84.26 
 
 		 1479 bp  79.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3075    85 
 
 		 192 bp  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  88.14 
 
 		 330 bp  61.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  88.14 
 
 		 330 bp  61.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  86.67 
 
 		 330 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  86.67 
 
 		 330 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  92.11 
 
 		 324 bp  52  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 		 378 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  91.43 
 
 		 324 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  91.43 
 
 		 327 bp  46.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>