24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3392 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3392  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 70 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3715  hypothetical protein  87.14 
 
 		 70 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0035  hypothetical protein  83.05 
 
 		 65 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0178  hypothetical protein  56.9 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2369  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3151  hypothetical protein  43.86 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2407  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000581897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1500  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315052  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3173  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0030247  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3286  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000244624  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1141  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000213136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2355  hypothetical protein  40.98 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2536  hypothetical protein  35.59 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4962  hypothetical protein  40.38 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000410502  normal  0.0158952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5515  hypothetical protein  36.76 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000658879  normal  0.233252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7016  hypothetical protein  39.22 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172189  hitchhiker  0.00191992 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5691  hypothetical protein  36.92 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000220142  decreased coverage  0.000175008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5168  hypothetical protein  36.92 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000181942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4545  hypothetical protein  36.92 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0317  hypothetical protein  41.3 
 
 		 63 aa  44.3  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1604  hypothetical protein  31.15 
 
 		 64 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  35.85 
 
 		 300 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0007  hypothetical protein  38.3 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000132585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2702  hypothetical protein  32.76 
 
 		 64 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.352826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>