22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7016 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7016  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172189  hitchhiker  0.00191992 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1500  hypothetical protein  60 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315052  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5515  hypothetical protein  56.92 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000658879  normal  0.233252 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1141  hypothetical protein  60 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000213136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3173  hypothetical protein  60 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0030247  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2407  hypothetical protein  60 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000581897  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4962  hypothetical protein  65.45 
 
 
75 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000410502  normal  0.0158952 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3286  hypothetical protein  62.5 
 
 
65 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000244624  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2369  hypothetical protein  64.29 
 
 
65 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000117975  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5168  hypothetical protein  65.45 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000181942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4545  hypothetical protein  65.45 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149159  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5691  hypothetical protein  65.45 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000220142  decreased coverage  0.000175008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0007  hypothetical protein  65.45 
 
 
73 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000132585  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0317  hypothetical protein  35 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3151  hypothetical protein  48 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133312  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3715  hypothetical protein  42.59 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0035  hypothetical protein  38.89 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3392  putative transmembrane anti-sigma factor  39.22 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2736  hypothetical protein  38.89 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1604  hypothetical protein  38.64 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2536  hypothetical protein  34.04 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3096  hypothetical protein  36.67 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>