23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0035 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0035  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3392  putative transmembrane anti-sigma factor  83.05 
 
 		 70 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3715  hypothetical protein  78.69 
 
 		 70 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0178  hypothetical protein  53.85 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3151  hypothetical protein  45.76 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2536  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763434 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2407  hypothetical protein  45.16 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000581897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1500  hypothetical protein  45.16 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315052  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2369  hypothetical protein  47.27 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3173  hypothetical protein  45.16 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0030247  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1141  hypothetical protein  45.16 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000213136  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3286  hypothetical protein  51.06 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000244624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2355  hypothetical protein  42.62 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7016  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172189  hitchhiker  0.00191992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0317  hypothetical protein  38.78 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1604  hypothetical protein  29.69 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4962  hypothetical protein  40.38 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000410502  normal  0.0158952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5515  hypothetical protein  40.82 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000658879  normal  0.233252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2702  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.352826 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5691  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000220142  decreased coverage  0.000175008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4545  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5168  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000181942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>