23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5168 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4545  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149159  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5168  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000181942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5691  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000220142  decreased coverage  0.000175008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0007  hypothetical protein  87.67 
 
 
73 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000132585  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5515  hypothetical protein  76.62 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000658879  normal  0.233252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4962  hypothetical protein  78.87 
 
 
75 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000410502  normal  0.0158952 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1500  hypothetical protein  68.97 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315052  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1141  hypothetical protein  68.97 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000213136  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3286  hypothetical protein  68.97 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000244624  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3173  hypothetical protein  68.97 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0030247  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2407  hypothetical protein  68.97 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000581897  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2369  hypothetical protein  67.24 
 
 
65 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000117975  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7016  hypothetical protein  65.45 
 
 
67 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172189  hitchhiker  0.00191992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3151  hypothetical protein  46 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133312  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3715  hypothetical protein  43.08 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2736  hypothetical protein  44.9 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1604  hypothetical protein  33.9 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0317  hypothetical protein  31.67 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3392  putative transmembrane anti-sigma factor  36.92 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2536  hypothetical protein  37.1 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0178  hypothetical protein  36.36 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2702  hypothetical protein  39.29 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.352826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0035  hypothetical protein  37.7 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.698407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>