24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2536 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2536  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  130  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2355  hypothetical protein  46.77 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4893  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00475897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0035  hypothetical protein  38.98 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3151  hypothetical protein  42.11 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3715  hypothetical protein  38.98 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3392  putative transmembrane anti-sigma factor  35.59 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0178  hypothetical protein  45.28 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1604  hypothetical protein  30.51 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4962  hypothetical protein  42.55 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000410502  normal  0.0158952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5515  hypothetical protein  42.55 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000658879  normal  0.233252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0007  hypothetical protein  44.68 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000132585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5168  hypothetical protein  37.1 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000181942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5691  hypothetical protein  37.1 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000220142  decreased coverage  0.000175008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7016  hypothetical protein  34.04 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172189  hitchhiker  0.00191992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4545  hypothetical protein  37.1 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2702  hypothetical protein  35.59 
 
 		 64 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.352826 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2407  hypothetical protein  38.3 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000581897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3173  hypothetical protein  38.3 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0030247  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3286  hypothetical protein  38.3 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000244624  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1141  hypothetical protein  38.3 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000213136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1500  hypothetical protein  38.3 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1015a  hypothetical protein  25.45 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2369  hypothetical protein  36.17 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000117975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>