12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2699 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2699  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4834  hypothetical protein  42.42 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4713  hypothetical protein  39.07 
 
 		 270 aa  98.2  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3864  hypothetical protein  39.13 
 
 		 167 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1706  hypothetical protein  34.15 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3062  hypothetical protein  31.08 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4579  hypothetical protein  43.21 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3871  hypothetical protein  38.89 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5460  hypothetical protein  30.95 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4237  hypothetical protein  27.48 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2893  hypothetical protein  32.93 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0213  hypothetical protein  32.93 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>