14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4579 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4579  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  328  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5460  hypothetical protein  46.2 
 
 		 245 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2893  hypothetical protein  35.81 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0213  hypothetical protein  35.81 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3871  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4834  hypothetical protein  42.86 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2892  hypothetical protein  28.12 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0214  hypothetical protein  28.12 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2699  hypothetical protein  43.21 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0249  hypothetical protein  32.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.884129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1706  hypothetical protein  30.67 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3870  hypothetical protein  31.13 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4713  hypothetical protein  30.82 
 
 		 270 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>