15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1706 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1706  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382544 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4834  hypothetical protein  45.78 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3864  hypothetical protein  36.81 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2699  hypothetical protein  34.15 
 
 		 169 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4713  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5460  hypothetical protein  32.45 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4579  hypothetical protein  30.67 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2661  hypothetical protein  32.84 
 
 		 126 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2893  hypothetical protein  24.12 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0213  hypothetical protein  24.12 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3062  hypothetical protein  29.7 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2892  hypothetical protein  29.46 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0214  hypothetical protein  29.46 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4237  hypothetical protein  29.56 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>