13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3062 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  324  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3045  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1695  hypothetical protein  30.92 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4834  hypothetical protein  32.45 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2699  hypothetical protein  31.08 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2154  hypothetical protein  27.56 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1675  hypothetical protein  33.79 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3864  hypothetical protein  31.06 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4237  hypothetical protein  43.66 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1706  hypothetical protein  29.7 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4713  hypothetical protein  29.76 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5905  hypothetical protein  34.09 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2661  hypothetical protein  28.36 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>