14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5460 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5460  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4579  hypothetical protein  46.2 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2893  hypothetical protein  32.76 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0213  hypothetical protein  32.76 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1706  hypothetical protein  32.45 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3871  hypothetical protein  35.37 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0249  hypothetical protein  31.1 
 
 		 168 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.884129 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4834  hypothetical protein  27.87 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3870  hypothetical protein  28.35 
 
 		 169 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2892  hypothetical protein  32.2 
 
 		 184 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0214  hypothetical protein  32.2 
 
 		 184 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2699  hypothetical protein  30.95 
 
 		 169 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4713  hypothetical protein  25.44 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6963  hypothetical protein  26.03 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>