208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0650 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2637  anion-transporting ATPase  77.61 
 
 		 590 aa  887    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473292  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0650  arsenite-activated ATPase ArsA  100 
 
 		 588 aa  1185    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0171508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2139  arsenite-activated ATPase ArsA  79.05 
 
 		 587 aa  923    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3664  arsenite-activated ATPase (arsA)  75.72 
 
 		 589 aa  867    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1491  arsenite-activated ATPase (arsA)  78.88 
 
 		 587 aa  924    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.738172  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2121  arsenical pump-driving ATPase  67.24 
 
 		 586 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000832973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0209  arsenite-activated ATPase ArsA  61.68 
 
 		 621 aa  691    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2343  arsenite-activated ATPase ArsA  65.03 
 
 		 588 aa  739    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000653299  normal  0.0206512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2187  arsenical pump-driving ATPase  67.07 
 
 		 586 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  67.18 
 
 		 729 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1654  arsenite-activated ATPase ArsA  66.9 
 
 		 589 aa  745    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3828  arsenite-activated ATPase ArsA  65.03 
 
 		 588 aa  739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000120267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01495  oxyanion-translocating ATPase  59.08 
 
 		 582 aa  680    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3731  arsenite-activated ATPase ArsA  53.39 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759868  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3705  arsenite-activated ATPase ArsA  52.66 
 
 		 584 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.430131  hitchhiker  0.00279853 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5668  arsenite-activated ATPase ArsA  53.09 
 
 		 587 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0306  arsenical pump-driving ATPase  48.7 
 
 		 586 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0156  arsenite-translocating ATPase ArsA  48.7 
 
 		 586 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1447  arsenite-transporting ATPase  54 
 
 		 571 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.463523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2710  arsenite-activated ATPase ArsA  53.51 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0184  arsenite-activated ATPase ArsA  49.57 
 
 		 603 aa  526  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.156138  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1347  arsenite-activated ATPase ArsA  49.14 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2513  arsenite-activated ATPase ArsA  48.88 
 
 		 586 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.020196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2152  arsenite-activated ATPase ArsA  44.19 
 
 		 582 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1189  arsenite-activated ATPase ArsA  45.9 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2390  arsenite-activated ATPase ArsA  47.54 
 
 		 579 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1381  arsenite-activated ATPase ArsA  48.4 
 
 		 583 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0938  arsenite-transporting ATPase  45.57 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0354  arsenite-activated ATPase ArsA  42.91 
 
 		 580 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2428  arsenical pump-driving ATPase  37.43 
 
 		 565 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.738989  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  33.6 
 
 		 640 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  33.5 
 
 		 643 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1224  Anion-transporting ATPase  32.8 
 
 		 456 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.916142  decreased coverage  0.000000394119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2410  arsenite-transporting ATPase  27.83 
 
 		 634 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  36.3 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.293828  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32803  predicted protein  27.97 
 
 		 800 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  35.71 
 
 		 318 aa  106  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1206  arsenite-activated ATPase ArsA  29.69 
 
 		 331 aa  105  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22896  predicted protein  29.87 
 
 		 349 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  29.76 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  29.54 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  27.91 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  29.71 
 
 		 407 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  27.9 
 
 		 405 aa  99.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  29.06 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1004  arsenite-activated ATPase ArsA  27.6 
 
 		 341 aa  97.8  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02640  conserved hypothetical protein  29.39 
 
 		 325 aa  97.8  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.14448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  29.39 
 
 		 405 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1512  arsenite-activated ATPase ArsA  29.34 
 
 		 345 aa  97.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.662645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  27.69 
 
 		 433 aa  97.4  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1163  arsenite-activated ATPase ArsA  29.34 
 
 		 345 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.841393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  27.74 
 
 		 433 aa  96.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0787  arsenite-activated ATPase ArsA  29.34 
 
 		 344 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03090  oxyanion-translocating ATPase  33.77 
 
 		 322 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  28.71 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  27.27 
 
 		 401 aa  95.1  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  31.02 
 
 		 409 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  28.17 
 
 		 433 aa  94.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1168  arsenite-activated ATPase ArsA  29.73 
 
 		 345 aa  94.4  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2005  arsenite-activated ATPase (arsA)  33.21 
 
 		 313 aa  94  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.41819  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3600  arsenite-activated ATPase ArsA  27.83 
 
 		 397 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  27.8 
 
 		 405 aa  93.6  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  29.3 
 
 		 433 aa  93.2  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2514  arsenite-activated ATPase ArsA  27.83 
 
 		 397 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.138109  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1297  arsenite-transporting ATPase  31 
 
 		 338 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  27.13 
 
 		 407 aa  91.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48071  pump-driving ATPase  28.9 
 
 		 347 aa  92  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0118158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  26.52 
 
 		 408 aa  91.3  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2327  arsenite-activated ATPase ArsA  25.81 
 
 		 626 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.761686  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  28.74 
 
 		 393 aa  90.9  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3278  arsenite-activated ATPase ArsA  27.18 
 
 		 394 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  27.19 
 
 		 400 aa  90.9  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  27.24 
 
 		 408 aa  90.9  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  27.51 
 
 		 395 aa  90.5  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  27.51 
 
 		 392 aa  90.5  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0450  arsenite-transporting ATPase  24.68 
 
 		 334 aa  90.1  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0025028  hitchhiker  0.000316077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0013  arsenite-activated ATPase ArsA  26.54 
 
 		 395 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1353  arsenite-activated ATPase ArsA  28.04 
 
 		 397 aa  88.6  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284232  hitchhiker  0.00308524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2084  arsenite-activated ATPase ArsA  27.33 
 
 		 395 aa  88.2  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0696  anion-transporting ATPase  26.28 
 
 		 314 aa  87.8  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1570  arsenite-activated ATPase ArsA  27.24 
 
 		 396 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02909  arsenite ATPase transporter (Eurofung)  29.48 
 
 		 340 aa  87.4  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.307729  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1521  arsenite-activated ATPase ArsA  27.53 
 
 		 395 aa  87  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0892  arsenite-transporting ATPase  23.14 
 
 		 334 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.449464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0928  arsenite-activated ATPase ArsA  27.24 
 
 		 396 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  28.57 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1219  Arsenite-transporting ATPase  28.81 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0862  arsenite-activated ATPase ArsA  23.19 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1125  arsenite-activated ATPase ArsA  28.35 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.485276  normal  0.386119 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1511  arsenite-activated ATPase ArsA  24.05 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0451  arsenite-transporting ATPase  28.62 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00229332  hitchhiker  0.000282817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1314  arsenite-activated ATPase (arsA)  30.18 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.735372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0070  anion-transporting ATPase  26.9 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0966  arsenite-activated ATPase ArsA  26.85 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2712  arsenite-activated ATPase ArsA  28.68 
 
 		 341 aa  83.2  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1088  arsenite-activated ATPase ArsA  26.58 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.782242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0908  arsenite-activated ATPase ArsA  27.18 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.26902  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2956  arsenite-activated ATPase ArsA  27.65 
 
 		 394 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00895235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1378  anion-transporting ATPase  26.58 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2829  arsenite-activated ATPase ArsA  30.28 
 
 		 637 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>