234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0966 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1173  anion-transporting ATPase  90.36 
 
 
396 aa  722    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.167129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1378  anion-transporting ATPase  90.36 
 
 
396 aa  728    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1088  arsenite-activated ATPase ArsA  90.61 
 
 
395 aa  726    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.782242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1521  arsenite-activated ATPase ArsA  88.83 
 
 
395 aa  707    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1125  arsenite-activated ATPase ArsA  85.32 
 
 
398 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.485276  normal  0.386119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0966  arsenite-activated ATPase ArsA  100 
 
 
397 aa  813    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1353  arsenite-activated ATPase ArsA  85.39 
 
 
397 aa  697    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284232  hitchhiker  0.00308524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0078  arsenite-activated ATPase ArsA  68.61 
 
 
396 aa  568  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.121619  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0070  anion-transporting ATPase  65.49 
 
 
406 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0091  arsenite-activated ATPase ArsA  64.99 
 
 
402 aa  534  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.304953  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0115  arsenite-activated ATPase ArsA  65.65 
 
 
404 aa  529  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1223  arsenite-activated ATPase ArsA  52.54 
 
 
399 aa  428  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293801  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  48.72 
 
 
401 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  48.21 
 
 
405 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  47.96 
 
 
405 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  48.21 
 
 
405 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  48.72 
 
 
406 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  48.21 
 
 
405 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  48.6 
 
 
408 aa  385  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  47.96 
 
 
408 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  49.11 
 
 
407 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  47.19 
 
 
407 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  47.19 
 
 
400 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2956  arsenite-activated ATPase ArsA  44.86 
 
 
394 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00895235  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0013  arsenite-activated ATPase ArsA  43.5 
 
 
395 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  42.26 
 
 
395 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3600  arsenite-activated ATPase ArsA  42.96 
 
 
397 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2514  arsenite-activated ATPase ArsA  42.71 
 
 
397 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.138109  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0222  arsenite-activated ATPase ArsA  43.32 
 
 
395 aa  344  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.267897  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0253  arsenite-activated ATPase ArsA  44.19 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3278  arsenite-activated ATPase ArsA  42.93 
 
 
394 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  43.83 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2084  arsenite-activated ATPase ArsA  40.9 
 
 
395 aa  335  5.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0213  arsenite-activated ATPase ArsA  42.04 
 
 
392 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.410604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2364  arsenite-activated ATPase ArsA  41.48 
 
 
395 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  42.64 
 
 
397 aa  315  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0363  anion-transporting ATPase family protein  40.36 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0288  arsenite-transporting ATPase  40.36 
 
 
393 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0285  anion-transporting ATPase  40.61 
 
 
393 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0349  anion-transporting ATPase family protein  40.36 
 
 
393 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4957  anion-transporting ATPase family protein  40.36 
 
 
392 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0297  arsenite-activated ATPase ArsA  40.1 
 
 
393 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0346  arsenite-activated ATPase (arsA)  40.61 
 
 
392 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0390  anion-transporting ATPase family protein  40.61 
 
 
393 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1511  arsenite-activated ATPase ArsA  38.31 
 
 
397 aa  305  9.000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3879  arsenite-activated ATPase ArsA  41.81 
 
 
391 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3240  arsenite-activated ATPase ArsA  40.91 
 
 
390 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.600829  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1570  arsenite-activated ATPase ArsA  38.79 
 
 
396 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0908  arsenite-activated ATPase ArsA  40.1 
 
 
404 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.26902  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0928  arsenite-activated ATPase ArsA  38.29 
 
 
396 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  38.93 
 
 
384 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1314  arsenite-activated ATPase (arsA)  41.21 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.735372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2570  Arsenite-transporting ATPase  37.4 
 
 
384 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0217  anion-transporting ATPase  38.17 
 
 
385 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  38.42 
 
 
384 aa  280  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2297  arsenite-activated ATPase ArsA  38.93 
 
 
384 aa  279  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0267  anion-transporting ATPase  38.93 
 
 
384 aa  278  9e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138882  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2143  arsenite-activated ATPase ArsA  37.82 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  37.4 
 
 
385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  35.26 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2699  Arsenite-transporting ATPase  36.22 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.768822  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3111  arsenite-transporting ATPase  34.34 
 
 
410 aa  225  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  33.75 
 
 
393 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1219  Arsenite-transporting ATPase  34.5 
 
 
407 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  32.5 
 
 
433 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  34.16 
 
 
433 aa  206  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  33.25 
 
 
434 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  32.75 
 
 
433 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  32.25 
 
 
433 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  32 
 
 
433 aa  203  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24880  oxyanion-translocating ATPase  33.67 
 
 
377 aa  203  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66061  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  32.17 
 
 
434 aa  202  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1387  Arsenite-transporting ATPase  29.95 
 
 
406 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.517206  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3094  arsenite-transporting ATPase  29.88 
 
 
404 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.968228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0303  anion-transporting ATPase, N-terminus  45.45 
 
 
169 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1823  arsenite-transporting ATPase  27.76 
 
 
401 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702579  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0302  anion-transporting ATPase, C-terminus  38.57 
 
 
217 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1163  arsenite-activated ATPase ArsA  35.33 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.841393  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0787  arsenite-activated ATPase ArsA  34.08 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1168  arsenite-activated ATPase ArsA  34.81 
 
 
345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1512  arsenite-activated ATPase ArsA  34.08 
 
 
345 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.662645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3546  arsenite-transporting ATPase  27.55 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.614872  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0875  anion-transporting ATPase  27.78 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0691273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0696  anion-transporting ATPase  32.59 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  30.45 
 
 
311 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.293828  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  32.17 
 
 
640 aa  124  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1004  arsenite-activated ATPase ArsA  32.69 
 
 
341 aa  119  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  30.57 
 
 
643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3279  arsenite-transporting ATPase  25.7 
 
 
421 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3341  arsenite-transporting ATPase  25.7 
 
 
421 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0464361  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2781  Anion-transporting ATPase  25.56 
 
 
367 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3290  arsenite-transporting ATPase  25.7 
 
 
421 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0184  arsenite-activated ATPase ArsA  29.1 
 
 
603 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.156138  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2461  arsenite-activated ATPase ArsA  29.39 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3644  arsenite-activated ATPase ArsA  28.27 
 
 
332 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1224  Anion-transporting ATPase  30.67 
 
 
456 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.916142  decreased coverage  0.000000394119 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5668  arsenite-activated ATPase ArsA  31.76 
 
 
587 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0156  arsenite-translocating ATPase ArsA  29.18 
 
 
586 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0306  arsenical pump-driving ATPase  29.18 
 
 
586 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0862  arsenite-activated ATPase ArsA  26.46 
 
 
334 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>