260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1447 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1447  arsenite-transporting ATPase  100 
 
 
571 aa  1117    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.463523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3705  arsenite-activated ATPase ArsA  67.25 
 
 
584 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.430131  hitchhiker  0.00279853 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5668  arsenite-activated ATPase ArsA  72.85 
 
 
587 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0156  arsenite-translocating ATPase ArsA  51.42 
 
 
586 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0306  arsenical pump-driving ATPase  51.42 
 
 
586 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1381  arsenite-activated ATPase ArsA  57.27 
 
 
583 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2710  arsenite-activated ATPase ArsA  58.81 
 
 
571 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0184  arsenite-activated ATPase ArsA  55.03 
 
 
603 aa  582  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.156138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1491  arsenite-activated ATPase (arsA)  54.2 
 
 
587 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.738172  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2139  arsenite-activated ATPase ArsA  53.94 
 
 
587 aa  571  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3731  arsenite-activated ATPase ArsA  54.13 
 
 
600 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759868  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2187  arsenical pump-driving ATPase  53.26 
 
 
586 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2121  arsenical pump-driving ATPase  52.56 
 
 
586 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000832973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2637  anion-transporting ATPase  53.6 
 
 
590 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473292  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0650  arsenite-activated ATPase ArsA  53.42 
 
 
588 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0171508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3664  arsenite-activated ATPase (arsA)  54.71 
 
 
589 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2390  arsenite-activated ATPase ArsA  51.6 
 
 
579 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1189  arsenite-activated ATPase ArsA  48.76 
 
 
578 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0209  arsenite-activated ATPase ArsA  52.04 
 
 
621 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01495  oxyanion-translocating ATPase  48.75 
 
 
582 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  52.37 
 
 
729 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1654  arsenite-activated ATPase ArsA  52.71 
 
 
589 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257726  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3828  arsenite-activated ATPase ArsA  50.26 
 
 
588 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000120267  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2343  arsenite-activated ATPase ArsA  50.26 
 
 
588 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000653299  normal  0.0206512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2152  arsenite-activated ATPase ArsA  45.92 
 
 
582 aa  522  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1347  arsenite-activated ATPase ArsA  50.44 
 
 
586 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2513  arsenite-activated ATPase ArsA  50.09 
 
 
586 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020196 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0938  arsenite-transporting ATPase  47.1 
 
 
583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0354  arsenite-activated ATPase ArsA  45.05 
 
 
580 aa  509  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2428  arsenical pump-driving ATPase  38.54 
 
 
565 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.738989  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  32.72 
 
 
643 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  33.05 
 
 
640 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1224  Anion-transporting ATPase  33.44 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.916142  decreased coverage  0.000000394119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  38.43 
 
 
311 aa  120  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.293828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2410  arsenite-transporting ATPase  28.24 
 
 
634 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1512  arsenite-activated ATPase ArsA  32.83 
 
 
345 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.662645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1163  arsenite-activated ATPase ArsA  32.83 
 
 
345 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.841393  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0787  arsenite-activated ATPase ArsA  41.67 
 
 
344 aa  104  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  27.63 
 
 
400 aa  104  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1004  arsenite-activated ATPase ArsA  32.69 
 
 
341 aa  103  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  26.75 
 
 
407 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1353  arsenite-activated ATPase ArsA  30.21 
 
 
397 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284232  hitchhiker  0.00308524 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1168  arsenite-activated ATPase ArsA  34.29 
 
 
345 aa  103  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  27.19 
 
 
407 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1125  arsenite-activated ATPase ArsA  30.61 
 
 
398 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.485276  normal  0.386119 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  26.65 
 
 
406 aa  98.6  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  25.69 
 
 
408 aa  97.8  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1173  anion-transporting ATPase  29.39 
 
 
396 aa  97.4  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.167129 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0966  arsenite-activated ATPase ArsA  29.09 
 
 
397 aa  97.1  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  26.13 
 
 
408 aa  96.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  31.46 
 
 
409 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1521  arsenite-activated ATPase ArsA  28.61 
 
 
395 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1378  anion-transporting ATPase  28.48 
 
 
396 aa  95.9  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1088  arsenite-activated ATPase ArsA  28.97 
 
 
395 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.782242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1570  arsenite-activated ATPase ArsA  29.69 
 
 
396 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02909  arsenite ATPase transporter (Eurofung)  28.95 
 
 
340 aa  94  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.307729  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0928  arsenite-activated ATPase ArsA  29.69 
 
 
396 aa  94  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  26.79 
 
 
405 aa  93.6  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0696  anion-transporting ATPase  29.39 
 
 
314 aa  93.6  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1219  Arsenite-transporting ATPase  36.6 
 
 
407 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  26.79 
 
 
405 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22896  predicted protein  32.3 
 
 
349 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0070  anion-transporting ATPase  28.1 
 
 
406 aa  91.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  26.99 
 
 
401 aa  92  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2327  arsenite-activated ATPase ArsA  23.99 
 
 
626 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.761686  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  25.99 
 
 
405 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  25.69 
 
 
405 aa  90.9  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  37.42 
 
 
385 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48071  pump-driving ATPase  28.11 
 
 
347 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0118158 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02640  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 
325 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.14448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0078  arsenite-activated ATPase ArsA  26.32 
 
 
396 aa  89  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.121619  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2712  arsenite-activated ATPase ArsA  34.97 
 
 
341 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0069  anion-transporting ATPase  24.07 
 
 
635 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127982  hitchhiker  0.00261779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  34.64 
 
 
434 aa  88.2  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3644  arsenite-activated ATPase ArsA  30.95 
 
 
332 aa  88.2  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  35.67 
 
 
318 aa  87.4  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  34.67 
 
 
434 aa  86.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32803  predicted protein  27.13 
 
 
800 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1223  arsenite-activated ATPase ArsA  26.01 
 
 
399 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293801  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1297  arsenite-transporting ATPase  30.98 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  32.02 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  30.9 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  30.77 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  25.47 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  31.84 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0908  arsenite-activated ATPase ArsA  31.17 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.26902  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0091  arsenite-activated ATPase ArsA  27.68 
 
 
402 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.304953  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  34 
 
 
433 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2005  arsenite-activated ATPase (arsA)  33.61 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.41819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0115  arsenite-activated ATPase ArsA  27.69 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1206  arsenite-activated ATPase ArsA  27.99 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24880  oxyanion-translocating ATPase  31.76 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66061  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2699  Arsenite-transporting ATPase  30.91 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.768822  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  26.3 
 
 
384 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  25.16 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  26.99 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3600  arsenite-activated ATPase ArsA  27.49 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2514  arsenite-activated ATPase ArsA  27.49 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.138109  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_12872  ArsAB family transporter: arsenite (ArsA)  27.92 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302636  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  26.85 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>