50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1535 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1535  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0209  hypothetical protein  92.08 
 
 		 102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2837  hypothetical protein  68.32 
 
 		 101 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.088426  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1921  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4444  hypothetical protein  64.56 
 
 		 83 aa  122  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5432  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1037  zinc finger, UBP-type  64.38 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  57.14 
 
 		 621 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2514  hypothetical protein  50.62 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410014  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6890  hypothetical protein  53.57 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5493  zinc finger UBP-type protein  51.76 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206165  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1047  zinc finger, UBP-type  53.57 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1043  zinc finger, UBP-type  53.57 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.394296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0986  zinc finger, UBP-type  60.56 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 626 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4439  hypothetical protein  55.84 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0813135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1954  hypothetical protein  50.59 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  45.68 
 
 		 624 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2623  zinc finger, UBP-type  54.12 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000246192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6099  zinc finger UBP-type protein  47.56 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7025  zinc finger UBP-type protein  50 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  0.19341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1984  hypothetical protein  48.24 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0788156  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2497  hypothetical protein  56.41 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0898974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6527  hypothetical protein  49.38 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  46.51 
 
 		 623 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1713  zinc finger UBP-type protein  51.16 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609811  normal  0.790052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0522  Zinc finger, UBP-type  49.43 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5266  hypothetical protein  46.51 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028842 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0534  zinc finger, UBP-type protein  49.43 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.990662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0370  hypothetical protein  47.13 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.113561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  45.68 
 
 		 624 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0512  zinc finger, UBP-type protein  46.67 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4964  hypothetical protein  46.43 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00620  hypothetical protein  52.56 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4591  zinc finger, UBP-type  45.16 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5074  hypothetical protein  46.43 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3395  hypothetical protein  47.37 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2997  hypothetical protein  43.53 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4885  hypothetical protein  46.67 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4502  hypothetical protein  46.67 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4589  hypothetical protein  46.67 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  44.29 
 
 		 624 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4046  hypothetical protein  54.41 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1176  zinc finger UBP-type protein  45.68 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2250  hypothetical protein  43.53 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.296979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0528  hypothetical protein  52.24 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.087644  hitchhiker  0.0000145749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0686  hypothetical protein  39.02 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0138  hypothetical protein  44.19 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2300  hypothetical protein  39.19 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0459  hypothetical protein  36.56 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.203925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>