50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4444 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4444  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  174  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1535  hypothetical protein  64.56 
 
 
102 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0209  hypothetical protein  65.82 
 
 
102 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  64.79 
 
 
621 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5432  hypothetical protein  65.43 
 
 
85 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4439  hypothetical protein  66.67 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0813135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2837  hypothetical protein  61.25 
 
 
101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.088426  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2514  hypothetical protein  61.04 
 
 
86 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410014  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2497  hypothetical protein  64.2 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0898974  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1047  zinc finger, UBP-type  60.98 
 
 
101 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1043  zinc finger, UBP-type  60.98 
 
 
101 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.394296  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1037  zinc finger, UBP-type  69.44 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1921  hypothetical protein  60.49 
 
 
100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0986  zinc finger, UBP-type  63.41 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6890  hypothetical protein  61.54 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5493  zinc finger UBP-type protein  60.49 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206165  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  54.43 
 
 
624 aa  110  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6527  hypothetical protein  59.49 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  55.13 
 
 
624 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2623  zinc finger, UBP-type  57.14 
 
 
87 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000246192  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7025  zinc finger UBP-type protein  58.23 
 
 
90 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  0.19341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1954  hypothetical protein  59.49 
 
 
99 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  51.22 
 
 
623 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4964  hypothetical protein  60 
 
 
113 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1713  zinc finger UBP-type protein  55.56 
 
 
100 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609811  normal  0.790052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6099  zinc finger UBP-type protein  58.54 
 
 
90 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999852  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0522  Zinc finger, UBP-type  54.12 
 
 
109 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0534  zinc finger, UBP-type protein  54.12 
 
 
109 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.990662  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  59.68 
 
 
626 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  61.67 
 
 
624 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0512  zinc finger, UBP-type protein  63.24 
 
 
109 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1984  hypothetical protein  51.85 
 
 
92 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0788156  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4591  zinc finger, UBP-type  59.42 
 
 
115 aa  96.7  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00620  hypothetical protein  51.85 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5266  hypothetical protein  52.44 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4046  hypothetical protein  51.16 
 
 
118 aa  91.7  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3395  hypothetical protein  57.97 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2997  hypothetical protein  56.52 
 
 
112 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5074  hypothetical protein  50.65 
 
 
121 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246247  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0370  hypothetical protein  52.44 
 
 
88 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.113561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0528  hypothetical protein  55.22 
 
 
171 aa  87.8  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.087644  hitchhiker  0.0000145749 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1176  zinc finger UBP-type protein  51.28 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0138  hypothetical protein  56.94 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4589  hypothetical protein  54.55 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4502  hypothetical protein  54.55 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4885  hypothetical protein  54.55 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2250  hypothetical protein  52.17 
 
 
115 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.296979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0686  hypothetical protein  52.86 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2300  hypothetical protein  47.22 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0459  hypothetical protein  48.44 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.203925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>