50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1176 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1176  zinc finger UBP-type protein  100 
 
 		 85 aa  176  8e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  53.25 
 
 		 624 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  52.44 
 
 		 623 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  50 
 
 		 624 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  53.03 
 
 		 621 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5432  hypothetical protein  55.56 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2514  hypothetical protein  60.27 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410014  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4444  hypothetical protein  51.28 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1043  zinc finger, UBP-type  53.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.394296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1047  zinc finger, UBP-type  53.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5493  zinc finger UBP-type protein  50 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206165  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0986  zinc finger, UBP-type  51.19 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6890  hypothetical protein  48.75 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4439  hypothetical protein  48.65 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0813135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2837  hypothetical protein  45.35 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.088426  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7025  zinc finger UBP-type protein  48.75 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  0.19341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0534  zinc finger, UBP-type protein  61.19 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.990662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  55 
 
 		 624 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0522  Zinc finger, UBP-type  61.19 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0512  zinc finger, UBP-type protein  61.19 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1037  zinc finger, UBP-type  50.7 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4046  hypothetical protein  71.74 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6527  hypothetical protein  48.05 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2623  zinc finger, UBP-type  52.94 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000246192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1535  hypothetical protein  45.68 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4964  hypothetical protein  48.75 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0209  hypothetical protein  46.91 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1921  hypothetical protein  41.46 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3395  hypothetical protein  48.61 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  46.03 
 
 		 626 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1954  hypothetical protein  41.77 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4502  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4885  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4589  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1713  zinc finger UBP-type protein  42.47 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609811  normal  0.790052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5074  hypothetical protein  37.21 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00620  hypothetical protein  43.24 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1984  hypothetical protein  44.59 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0788156  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0370  hypothetical protein  46.25 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.113561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6099  zinc finger UBP-type protein  47.37 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0138  hypothetical protein  42.67 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2497  hypothetical protein  43.94 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0898974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2250  hypothetical protein  40.85 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.296979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5266  hypothetical protein  43.04 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2997  hypothetical protein  41.43 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4591  zinc finger, UBP-type  38.57 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0528  hypothetical protein  42.65 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.087644  hitchhiker  0.0000145749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2300  hypothetical protein  38.67 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0686  hypothetical protein  34.72 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0459  hypothetical protein  38.36 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.203925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>