13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6319 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6319  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4398  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600888  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8613  RES domain protein  28.99 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4168  hypothetical protein  33.86 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.775422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2043  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1389  hypothetical protein  28.73 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4703  RES domain protein  34.09 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2362  hypothetical protein  28.04 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493279  hitchhiker  0.0000182062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1176  hypothetical protein  31.17 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4480  RES domain protein  26.96 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0402  hypothetical protein  27.42 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0802  RES domain-containing protein  28.8 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0740  hypothetical protein  29.23 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147552  normal  0.723454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>