11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4480 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4480  RES domain protein  100 
 
 
203 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8613  RES domain protein  28.57 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4398  hypothetical protein  29.25 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0802  RES domain-containing protein  29.38 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5508  RES domain protein  24.86 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1176  hypothetical protein  28.48 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6319  hypothetical protein  26.96 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1405  RES domain protein  28 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25810  RES domain-containing protein  22.29 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1389  hypothetical protein  23.57 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0402  hypothetical protein  24.84 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>