9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1176 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1176  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  433  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1405  RES domain protein  36.41 
 
 
226 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1583  hypothetical protein  30.97 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.164728  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5317  RES  27.72 
 
 
257 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.140146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3432  RES domain protein  28.74 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2428  RES domain-containing protein  27.56 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6319  hypothetical protein  31.17 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645012  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4480  RES domain protein  28.48 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3439  RES domain-containing protein  27.41 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>