10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5317 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5317  RES  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1583  hypothetical protein  44.58 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.164728  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2428  RES domain-containing protein  43.68 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3432  RES domain protein  40.68 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3439  RES domain-containing protein  37.86 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1405  RES domain protein  30.85 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1176  hypothetical protein  27.55 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8613  RES domain protein  27.95 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4398  hypothetical protein  27.93 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  30.43 
 
 		 313 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>