13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8613 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8613  RES domain protein  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4398  hypothetical protein  58.91 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0402  hypothetical protein  42.71 
 
 
199 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338341  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4168  hypothetical protein  33.73 
 
 
194 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.775422  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4703  RES domain protein  32 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272414  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4480  RES domain protein  28.57 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0802  RES domain-containing protein  33.17 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6319  hypothetical protein  28.99 
 
 
218 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645012  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2043  hypothetical protein  28.29 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3432  RES domain protein  26.25 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229782  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1389  hypothetical protein  23.3 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5317  RES  27.95 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.140146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2362  hypothetical protein  24.43 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493279  hitchhiker  0.0000182062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>