15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4398 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4398  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600888  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8613  RES domain protein  58.91 
 
 
225 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0402  hypothetical protein  43.37 
 
 
199 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338341  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4168  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.775422  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4703  RES domain protein  34.73 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272414  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6319  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645012  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0802  RES domain-containing protein  30.92 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4480  RES domain protein  29.25 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3379  hypothetical protein  30.77 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3025  hypothetical protein  30.05 
 
 
216 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484732  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2043  hypothetical protein  26.44 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1405  RES domain protein  25.44 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1389  hypothetical protein  25.29 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5317  RES  27.93 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.140146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2362  hypothetical protein  27.85 
 
 
210 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493279  hitchhiker  0.0000182062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>