8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2362 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2362  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493279  hitchhiker  0.0000182062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1389  hypothetical protein  88.29 
 
 		 205 aa  373  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2043  hypothetical protein  76.24 
 
 		 207 aa  310  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0740  hypothetical protein  80.88 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147552  normal  0.723454 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6319  hypothetical protein  28.04 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0802  RES domain-containing protein  28.4 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8613  RES domain protein  24.43 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4398  hypothetical protein  27.85 
 
 		 202 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>