53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5834 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5834  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0594  PAP2 family protein  37.38 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1575  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.3 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1188  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.31 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2235  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.98 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  0.310017 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3861  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.3 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0697193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3666  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.3 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  0.519121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4503  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.3 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2563  major facilitator superfamily permease  38.16 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1675  PAP2 family protein  38.16 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.840167  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0331  PAP2 family membrane protein  38.16 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1479  PAP2 family membrane protein  38.16 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0866  PAP2 family protein  38.16 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2426  PAP2 family membrane protein  38.16 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.691634  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0300  PAP2 family protein  38.16 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3758  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.0238717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3229  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.427666 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2847  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.95 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4884  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.3 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4406  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.28 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265385  normal  0.277633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6803  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.49 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.687594  hitchhiker  0.000000852518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0096  hypothetical protein  41.42 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134789  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0525  PAP2 family protein  36.5 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6188  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.43 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6736  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0648  PAP2 family membrane protein  38.06 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0811  PAP2 superfamily protein  38.06 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0033  PAP2 family protein  38.06 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0633  PAP2 superfamily protein  38.06 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2503  PAP2 family membrane protein  36.76 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2203  PAP2 family protein  36.76 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2881  PAP2 family membrane protein  36.76 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.538288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7386  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.84 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5919  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.99 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208723  normal  0.373663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3727  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.67 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0651813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1349  PAP2 family protein  31.97 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3265  PAP2 family membrane protein  32 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51650  phosphoesterase protein  33.14 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3705  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.99 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3277  PAP2 family protein  32 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5366  transmembrane protein  29.41 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3803  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.41 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4560  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.41 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3721  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.41 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0369541  normal  0.206135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.16 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4934  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.97 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3228  PAP2 family membrane protein  32.24 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2293  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.21 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.67 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_003296  RS02338  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0193452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0713  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.31 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.065408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2226  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.54 
 
 		 198 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 251 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.757531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>