52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5919 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5919  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
197 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208723  normal  0.373663 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6188  phosphoesterase, PA-phosphatase related  96.45 
 
 
195 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7386  phosphoesterase, PA-phosphatase related  80.3 
 
 
195 aa  291  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3265  PAP2 family membrane protein  62.18 
 
 
190 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3277  PAP2 family protein  62.18 
 
 
190 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1349  PAP2 family protein  62.69 
 
 
193 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6736  phosphoesterase PA-phosphatase related  56.7 
 
 
206 aa  201  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3228  PAP2 family membrane protein  61.66 
 
 
190 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.42 
 
 
198 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3705  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.48 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3721  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.95 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0369541  normal  0.206135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3803  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.95 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.10058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4560  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.95 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2293  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.37 
 
 
196 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4934  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.97 
 
 
196 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3727  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.16 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0651813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3861  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.74 
 
 
232 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0697193  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3666  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.74 
 
 
232 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  0.519121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4503  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.74 
 
 
232 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2847  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.78 
 
 
233 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0594  PAP2 family protein  39.89 
 
 
232 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2235  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.11 
 
 
232 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  0.310017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4884  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.45 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3229  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.69 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.427666 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2426  PAP2 family membrane protein  39.89 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.691634  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1479  PAP2 family membrane protein  39.89 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3758  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.69 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.0238717 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1675  PAP2 family protein  39.89 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.840167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0866  PAP2 family protein  39.89 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0331  PAP2 family membrane protein  39.89 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2563  major facilitator superfamily permease  39.89 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0300  PAP2 family protein  39.89 
 
 
232 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6803  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.78 
 
 
233 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.687594  hitchhiker  0.000000852518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4406  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.38 
 
 
243 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265385  normal  0.277633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0525  PAP2 family protein  33.18 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1575  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.69 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1188  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5834  hypothetical protein  34.67 
 
 
226 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0033  PAP2 family protein  40.44 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2503  PAP2 family membrane protein  40.15 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0648  PAP2 family membrane protein  40.44 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0633  PAP2 superfamily protein  40.44 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2203  PAP2 family protein  40.15 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2881  PAP2 family membrane protein  40.15 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.538288  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0811  PAP2 superfamily protein  40.44 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0729  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.95 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0096  hypothetical protein  36.31 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134789  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5366  transmembrane protein  31.21 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  29.46 
 
 
248 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.55 
 
 
249 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_003296  RS02338  hypothetical protein  33.58 
 
 
223 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0193452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.81 
 
 
267 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>