50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3705 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3705  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  97.98 
 
 
198 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2293  phosphoesterase, PA-phosphatase related  85.2 
 
 
196 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3803  phosphoesterase, PA-phosphatase related  82.65 
 
 
196 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.10058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3721  phosphoesterase PA-phosphatase related  82.65 
 
 
196 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0369541  normal  0.206135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4560  phosphoesterase, PA-phosphatase related  82.65 
 
 
196 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4934  phosphoesterase PA-phosphatase related  81.44 
 
 
196 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3727  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.43 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0651813 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6188  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50 
 
 
195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5919  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.48 
 
 
197 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208723  normal  0.373663 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3265  PAP2 family membrane protein  52.66 
 
 
190 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3277  PAP2 family protein  52.66 
 
 
190 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7386  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.89 
 
 
195 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1349  PAP2 family protein  51.56 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6736  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.24 
 
 
206 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3228  PAP2 family membrane protein  51.6 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2847  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.01 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2235  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.95 
 
 
232 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  0.310017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4503  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.95 
 
 
232 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3666  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.95 
 
 
232 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  0.519121 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3861  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.95 
 
 
232 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0697193  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3229  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
232 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.427666 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3758  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
232 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.0238717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6803  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.42 
 
 
233 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.687594  hitchhiker  0.000000852518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4406  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.41 
 
 
243 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265385  normal  0.277633 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0594  PAP2 family protein  36.41 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0300  PAP2 family protein  37.69 
 
 
232 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4884  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.85 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192734 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1479  PAP2 family membrane protein  37.69 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1675  PAP2 family protein  37.69 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.840167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0866  PAP2 family protein  37.69 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2563  major facilitator superfamily permease  37.69 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2426  PAP2 family membrane protein  37.69 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.691634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0331  PAP2 family membrane protein  37.69 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1188  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.55 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0525  PAP2 family protein  35.04 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1575  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.09 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0633  PAP2 superfamily protein  38.64 
 
 
244 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0811  PAP2 superfamily protein  38.64 
 
 
244 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0033  PAP2 family protein  38.64 
 
 
244 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2503  PAP2 family membrane protein  37.31 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0648  PAP2 family membrane protein  38.64 
 
 
244 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2203  PAP2 family protein  37.31 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2881  PAP2 family membrane protein  37.31 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.538288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5366  transmembrane protein  31.03 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5834  hypothetical protein  28.99 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51650  phosphoesterase protein  31.25 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0096  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134789  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0729  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.6 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_003296  RS02338  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0193452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>